合成生物学

服务项目

• 
  酶催化服务平台
  查看详情
  01

合成生物学平台

• 酶催化平台
  巧妙利用酶催化与合成生物学，能够有效缩短合成路径，降低成产成本，提高新药开发合成的效率。
  酶库构建（目标：构建2000种催化化学反应的酶） 酶定向进化 建立基因突变库（采用理性设计和半理性设计相结合的策略） 高通量筛选（平板筛选法、微孔板筛选法、FACS筛选) 修饰核苷合成（低附加值核苷在酶的催化下转换成高附加值核苷） 非天然氨基酸合成（酶催化） 药物中间体的合成（利用酶催化减少化学反应流程，降低成本，应用于工艺放大流程）
  
• 环肽筛选平台-mRNA展示技术
  mRNA展示技术是将基因型(mRNA)与表型(多肽/蛋白)融合的体外多肽/蛋白筛选技术，将肽与其编码mRNA进行共价连接，使用嘌呤霉素作为连接物。云顶yd222线路检测应用此技术构建规模超过10¹³的mRNA展示库，通过无细胞PURE体外翻译系统将非天然氨基酸整合到多肽中，经过对靶标蛋白的亲和纯化后对与多肽连接的cDNA进行测序，可精准筛选到与靶标相互作用的多肽。
• mRNA展示库的构建
  DNA库制备：使用分子生物学技术制备DNA库(通常为编码约15个氨基酸的环肽) DNA库的体外转录：通过RNA聚合酶的作用，DNA库被转录成mRNA 嘌呤霉素连接：嘌呤霉素分子通过DNA连接子序列连接到每个mRNA上，嘌呤霉素是一种抗生素，作为氨基酰化的tRNA类似物(tRNA在翻译过程中向核糖体传递氨基酸)，并作为mRNA和肽之间的连接子 mRNA库的体外翻译：mRNA-嘌呤霉素偶联物进行体外翻译，由核糖体翻译生成相应的肽 线性肽的环化修饰：通过化学合成技术进行环化修饰 逆转录：mRNA逆转录形成mRNA-cDNA双链，产生mRNA/cDNA-嘌呤霉素-肽偶联物库
  整个过程均在体外进行，无需依靠细胞。
• 体外筛选
  孵育与洗涤：将mRNA-cDNA-肽融合库与固定在固体载体上的靶蛋白一起孵育，然后进行洗涤以去除未结合的肽 扩增、富集与测序：结合肽的cDNA通过PCR扩增，然后用作DNA库模板，在进一步的重复几轮mRNA展示库筛选中，富集与靶蛋白高亲和力的结合肽，最后通过cDNA的测序来确定多肽的结构
  

  Nat Rev Chem. 2020, 4(2): 90-101. doi: 10.1038/s41570-019-0159-2.Trends Pharmacol Sci. 2021, 42(5): 385-397. doi: 10.1016/j.tips.2021.02.004.

  除了多肽药物体外筛选，云顶yd222线路检测还可以提供多肽药物的合成服务。云顶yd222线路检测多肽合成研究团队长期致力于解决限制多肽药物发展和应用的核心问题，目前已建立了从上游非天然氨基酸结构单元的合成、多肽药物修饰和大规模合成，到下游多肽药物信号转导通路和作用机制研究的完善体系。
  了解更多：云顶yd222线路检测多肽合成业务

云顶yd222线路检测合成生物学服务平台优势

• （1）拥有成熟的生物信息学和分子生物学技术平台，能根据客户需求快速地进行数据挖掘和酶开发；（2）拥有较为完备的生物转化能力，提供更为环保和经济的工艺，满足客户降低成本和稳定供应的需求； （3）拥有mRNA展示技术平台，能进行线性肽类药物、环肽类药物等的前期筛选和后期多肽的合成等工作。（4）拥有小核酸药物的固相合成平台，并致力于酶催化寡核苷酸合成（ECOS）平台

• 

  小分子药物合成，如非天然氨基酸、多功能醇等；采用酶法催化或者细胞工厂。

  

  小肽药物的筛选与合成，如司美格鲁肽、大环肽等；采用mRNA display筛选技术等。

  

  ADC定点偶联及蛋白修饰，如Sortase酶和谷氨酰胺转氨酶的应用。

  

  小核酸药物合成，如小干扰RNA、反义寡核苷酸、信使RNA、核酸适配体等。

• 寡核苷酸药物
  

  Michael A. Jensen and Ronald W. Davis Biochemistry 2018 57 (12), 1821-1832 DOI: 10.1021/acs.biochem.7b00937

  酶法寡核苷酸合成末端脱氧核苷酸转移酶（TdT）3ʹ-保护核苷5ʹ-三磷酸（NTP）底物3’封闭基团的解封闭

  

  3’封闭NTP的生物催化合成
• 肽/蛋白质
  

  重组DNA技术用于肽/蛋白质/抗体合成

  

  Source: Nuijens T, Toplak A, Schmidt M, Ricci A and Cabri W (2019) Natural Occurring and Engineered Enzymes for Peptide Ligation and Cyclization.Front.  Chem. 7:829. doi: 10.3389/fchem.2019.00829

  酶促肽连接和环化
  肽连接酶：分选酶 A (SrtA)Butelase-1胰蛋白酶连接酶……
• 核苷

  

  酶级联至核苷用于合成核苷的酶级联反应

  抗体药物

  

  位点特异性蛋白质修饰胰蛋白酶连接酶全连接酶转谷氨酰胺酶分选酶A (SrtA)……

相关文章